长期围绕蔬菜抗逆、高产及其调控的关键科学问题开展研究，在番茄等喜温性果菜对低温逆境的响应机制及调控、器官互作信号和光质信号调控抗逆性和养分吸收机制及其利用等方面取得了突破，并建立系列光合和抗逆调控技术，为实现蔬菜高产高效和可持续生产提供了理论和技术支撑。

主要研究内容为：（1）ROS、Ca²⁺、激素等信号系统及调控网络；（2）光信号与温度信号整合机制；（3）抗性、产量与品质协同调控分子机制；（4）器官互作调控抗逆性机制及其信号分子挖掘；（5）植物菌根共生的系统调控与养分高效利用；（6）光信号系统调控株型与养分吸收机制

1.主持项目情况

近5年，先后主持国家“十三五”重点研发计划项目、国家自然科学基金杰出青年科学基金项目、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金区域创新发展联合基金重点支持项目等多项。

（1）国家“十三五”重点研发计划，2018YFD1000800，“园艺作物生长发育对设施环境的响应机制与调控”，主持，执行年限：2018-2022

（2）国家自然科学基金杰出青年科学基金项目，31825023，“设施蔬菜逆境响应与调控”，主持，执行年限：2019-2023

（3）国家自然科学基金重点项目，32330094，“光温信号协同激素信号调控番茄株型的分子机制”，主持，执行年限：2024-2028

（4）国家自然科学基金区域创新发展联合基金重点支持项目，U21A20233，“光温互作信号协同调控番茄产量和品质机制研究”，主持，执行年限：2022-2025

（5）国家特色蔬菜产业技术体系岗位专家，执行年限：2017-2025

2.代表性论著

出版著作3部；在国内外学术刊物上以第一或通讯作者发表学术论文70余篇。代表性论文有：

[1]Dong H^#, Wang JC^#, Song XW, Hu CY, Zhu CA, Sun T, Zhou ZW, Hu ZJ, Xia XJ, Zhou J, Shi K,Zhou YH*, Foyer CH*, Yu JQ*. HY5 functions as a systemic signal by integrating BRC1-dependent hormone signaling in tomato bud outgrowth.PNAS, 2023,120(16): e301879120.

[2]Song JN, Lin R, Tang MJ, Wang LY, Fan PX, Xia XJ, Yu JQ,Zhou YH*. SlMPK1- and SlMPK2-mediated SlBBX17 phosphorylation positively regulates CBF-dependent cold tolerance in tomato.New Phytologist,2023, 239(5): 1887-1902.

[3]Xu J, Liu SD, Cai LC, Wang LY, Qi ZY, Yu JQ,Zhou YH*. SPINDLY interacts with EIN2 to facilitate ethylene signaling-mediated fruit ripening in tomato.Plant Biotechnology Journal,2023, 21: 219-231.

[4]Xu J, Huang ZL, Du HY, Tang MJ, Fan PX, Yu JQ,Zhou YH*. SEC1-C3H39 module fine-tunes cold tolerance by mediating its target mRNAs degradation in tomato.New Phytologist,2023, 237: 870-884

[5]Ge SB, Jin LJ, Yao KQ, Wang Y, Wu XD, Zhou J, Xia XJ, Shi K, Yu JQ,Zhou YH*. Light-dependent activation of HY5 promotes mycorrhizal symbiosis in tomato by systemically regulating strigolactone biosynthesis.New Phytologist, 2022, 233: 1900–1914.

[6]Guo ZX^#, Xu J^#, Wang Y, Hu CY, Shi K, Zhou J, Xia XJ,Zhou YH*, Foyer CH*, Yu JQ*. The phyB-dependent induction of HY5 promotes iron uptake by systemically activating FER expression.EMBO reports, 2021,22: e51944

[7]Wang F^#, Chen XX^#, Dong SJ, Jiang XC, Wang LY, Yu J,Zhou YH*. Crosstalk of PIF4 and DELLA modulates CBF transcript and hormone homeostasis in cold response in tomato.Plant Biotechnology Journal, 2020,18(4): 1041-1055.